Logo Madrasah Al-Aminiah menggunakan tiga warna asas iaitu kuning,hijau dan putih.
RASIONAL WARNA LOGO
KUNING
Warna diraja yang melambangkan kemuliaan dan sinaran ilmu.Mencari ilmu (agama) adalah kewajiban bagi setiap Muslim.
PUTIH
Melambangkan kesucian,keluhuran dan keikhlasan hati setiap pelajar dalam menuntut ilmu pengetahuan.
HIJAU
Lambang keikhlasan sesuai dengan Madrasah ini di mana matapelajaran yang berorientasikan agama Islam.